为了解决间歇式生产小锅炉废气监测的问题，第三方检测机构在采集燃烧天然气锅炉烟囱废气时面临诸多挑战，尤其是如何合规监测二氧化硫和氮氧化物，在废气排放不连续的情况下。在间歇性生产模式下，企业锅炉每分钟燃烧后停顿，导致监测时氧含量激增，折算浓度超出标准，而间断监测又不符合规范。

广东省生态环境厅在2023年6月15日提供了专业指导，依据《固定污染源废气监测技术规范》（HJ/T 397-2007）第10.2条，针对间断排放的排气筒，应在排放时段内连续采样，或等间隔采集2至4个样品，并计算平均值，确保监测数据准确性和代表性。

监测二氧化硫和氮氧化物的常用方法包括定电位电解法（HJ 57、HJ 693）、非分散红外吸收法（HJ 629、HJ 692）、便携式紫外吸收法（HJ 1131、HJ 1132）以及便携式傅立叶变换红外光谱法（HJ 1240）。检测机构应根据实际情况选择最合适的监测方法，确保数据可靠性和合规性。

综上，遵循专业指导和合理选择监测技术，可有效应对间歇式生产小锅炉废气监测难题，确保数据准确性和合规性。广东省生态环境厅的指导为这一问题提供了明确的解决方案，为第三方检测机构提供了宝贵的信息。